只有菌種好，靈芝才能好，孢子粉才能更好。
不管是山東等地的仿野生培育還是長白山地區的塑料大棚種植，都需要靈芝菌種。靈芝菌種主要有兩個來源，一是在用當地野生靈芝為母本培育改良，二是異地引進（從別的地區買進）。
泰山野生靈芝
第一種來源需投入較高昂的研發成本，第二種則只需批量購買即可，成本較低。所以，從菌種來源上就會產生價格上的差異。
從品質上講，以當地野生靈芝為母本改良的菌種更適合當地環境，質地純正，靈芝孢子粉品質更好，山東泰山等地主要采取此種方式，正宗泰山靈芝可以一味成方根源就在靈芝菌種；
像長白山等地主要從異地遷入菌種，原因是當地溫度低，野生環境下無赤靈芝生長，也就無法在當地培育菌種了。需要指出的是，此種方式需考慮環境的變化對靈芝品質的不良影響。
